Родился в полковом городе Нежине в семье протоиерея Нежинской церкви Иоанна Богослова Фёдора Герасимовича  и его жены Фотины Осиповны.

 

Участвовал на нём в Гогландском, Эландском, Ревельском и Выборгском морских сражениях. В марте 1789 года произведён в мичманы «за отличия», а в 1793 году — в лейтенанты. В 1793—1799 годах проходил военную службу волонтёром на кораблях английского флота. В эти годы много плавал в Северную Америку и к канадским берегам, в Южную Африку, Индию.

​

В 1803—1806 годах Иван Крузенштерн и Юрий Лисянский на шлюпах «Надежда» и «Нева» совершили первую в истории российского флота кругосветную экспедицию. Ю.Лисянский командовал «Невой» и открыл один из Гавайских островов, названный его именем (остров Лисянского, США). Ю.Лисянский первым описал Гавайи в книге «Путешествие вокруг света» (1812). 

​

В 1807—1808 годах командовал линейным кораблём «Зачатие Святой Анны» и корветом «Эмгейтен», участвовал в боевых действиях англо-русской и русско-шведской войн.

​

В 1820 году шведский король Карл XIV Юхан пожаловал Ю. Лисянскому орден Меча за успехи в мореплавании.

​

​

​